Обитатели почвы влияют на физические, химические и биологические свойства почвы. Так, корневые системы высших растений улучшают структуру почвы, обеспечивая аэрацию и поступления растворов солей. Живые и отмершие подземные части растений обогащают почву органикой, служат кормовой базой для почвенных животных, грибов, бактерий. Некоторые из микроорганизмов, которые существуютют в свободном состоянии или вступают в симбиоз с высшими растениями (азотфиксирующие бактерии, цианобактерии, некоторые почвенные водоросли) , способные фиксировать атмосферный азот и тем самым обогащать почву его соединениями, повышая плодородие. На структуру почв влияет и деятельность определенных групп животных, в частности тех, что способны прокладывать в почве ходы, разрыхляя его (дождевые черви, некоторые насекомые, кроты и др.) . Кроме того, животные обогащают почву органикой (экскременты, отмершие остатки) и участвуют в ее разложении (насекомые, клещи, круглые черви, простейшие и др.). . Особая роль в этих процессах принадлежит дождевым червям, которые транспортируют органические остатки с поверхности почвы в его глубину.